作為在生態環保咨詢領域有較強影響力的綜合性環境科研、規劃和咨詢服務機構，公司組建了國環研究院。截止2025年，國環研究院擁有研發人員38人，其中博士2名，碩士27人，碩士以上學歷占總人數73.68%，承擔多項生態環保科研課題，涉及環境影響評價和污染治理、排污許可、生態環保規劃、大宗固廢利用等門類，取得了驕人業績。
科研成果
1、通州灣示范區現代紡織產業園基于園區納污水體水環境容量核算
2、2022年重點行業生態環境統計與排污許可管理試點
3、關于固定污染源大氣、水污染物排放達標區與非達標區劃定研究
4、華東片區部分行業排污許可證質量抽查、典型企業臺賬填報質量抽查分析研究
5、造紙和火電行業排污許可與生態環境統計制度銜接調研與研究
6、原料藥、農藥、石化行業許可證及執行報告質量分析研究
7、羽毛(絨)加工工業排污許可證排放量核算方法研究
8、羽毛(絨)加工工業排污許可證申請與核發技術規范編制
9、環評、環保稅、執法等制度體系與排污許可制度銜接和融合現狀研究
10、排污許可分類管理與環評分類管理差異分析研究
11、環境保護部天津天鐵冶金集團有限公司熱軋板卷工程環境影響后評價研究項目
12、區域許可排放限值確定方法及環境影響后評價反饋排污許可的管理機制研究
13、大宗固廢資源化綜合利用技術
14、城區及城郊入河面源（初期雨水）污染控制技術研究
15、突發環境事件環境影響評價技術方法研究
16、中核生態環境有限公司科研實驗服務項目驗證評估報告
17、原料藥、農藥、石化行業排污許可證及執行報告質量分析研究
18、環評、環保稅、執法等制度體系與排污許可制度銜接和融合現狀研究
19、原料藥、農藥、石化行業許可證及執行報告質量分析研究
20、惠安縣石雕行業標準化導則編制
21、固廢及副產物硫酸環保管理專項技術報告
22、重點產業布局環境敏感性分析研究
23、關于固定污染源大氣、水污染物排放達標區與非達標區劃定研究
24、區域級固定污染源排污許可信息管理系統
25、生態環境綜合整治與環保信息化監管系統
26、連云港堿渣治理與資源化利用創新示范項目規模試驗
27、化工園碳排放實時監控系統
公司積極開展與高校之間的合作，其中與南京信息工程大學開展了“溫排水水溫及余氯對河流水質影響的數值擬研究”，在調查西塘河、黃沙港河道地形、流量、水質資料基礎上，構建二維非穩態水環境數值模型，并對模型關鍵水動力、水溫、水質參數進行率定驗證。成果已應用于相關環評業務中。
與南京理工大學共建江蘇省化工污染控制與資源化高校重點實驗室，圍繞國家中長期科學與技術發展規劃，以具有前瞻性、先導性和探索性的高水平學術創新和重大工程成果產出為核心，圍繞化工廢水處理與資源化理論與技術、面向有毒污染物質深度處理與資源化的環境功能材料、化工污染物毒性識別與健康評價、面向化工污染物重度污染修復技術等方向開展跨學科的創新性基礎研究、技術開發和工程應用。
除此之外，公司與中國礦業大學、南京工業大學等高校簽訂了研究生校外培養協議，按照“產教融資源共享、互利共贏、協同創新”原則，開展高層次人才聯合培養，為國家行業單位輸送理論合格、基礎扎實、解決實際問題能力突出的專業實踐型高層次人才。
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